2019年9月，省科技厅启动建设联合实验室工作，目的是结合国家战略及粤港澳大湾区科技创新及产业发展实际需求，发挥港澳地区的国际化优势和广东改革开放先行先试优势，瞄准世界科技前沿，汇聚粤港澳创新资源、创新科研合作模式，打造高水平科技创新载体和平台。
2019年12月19日，首批10家联合实验室授牌，广州市6家。2020年11月25日，第二批10家联合实验室授牌，广州市4家。目前在穗粤港澳联合实验室已达10家，其中牵头单位为高校的有6家（华南理工大学、暨南大学、华南师范大学、中山大学各1家，广东工业大学2家），牵头单位为科研机构的有4家（中国科学院广州地球化学研究所、广东省人民医院、广州医科大学附属第一医院、广州中医药大学第二附属医院各1家），主要分布在新材料、先进制造、生物医药、环境科技等重点领域。
港澳参与方包括香港大学、香港科技大学、香港理工大学、香港中文大学、香港城市大学、香港浸会大学、澳门大学、澳门科技大学等8所高校。
联合实验室建设周期均为三年，每家首期建设经费均为500万元
联合实验室建设取得良好成效
联合实验室成立以来，在广东经济社会发展提供关键性支撑上取得了良好成效，特别是在新冠肺炎防控科技攻关中，粤港澳呼吸系统传染病联合实验室、粤港澳中医药与免疫疾病研究联合实验室等在病毒溯源、治疗药物、快速检测及公共支撑服务上做出了积极贡献。
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